KIUアカデミーは、1年生から12年生までのすべてのカリキュラムにおいて、米国西部地域私立学校大学協会 WASC（Western Association of Schools and Colleges）及びキリスト教系インターナショナルスクール連盟 ACSI（Association of Christian Schools International） の認可を受けています。

WASC 及び ACSI はアメリカに本部を持つ教育認定機関であり、その認定は世界的な資格として活用されています。国内においては文部科学省により、認定校で12年の課程を修了した18歳以上の者には、大学入学資格（高等学校を卒業した者と同等以上の学力があること）が認められています。

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またKIUアカデミー高等部2～4年（国内高校1～3年に相当）は京都府により各種学校としての認可を受けており、高等学校等就学支援金制度の対象となっています。